日本签证要查户口吗？
我办理过多次签证，包括个人旅游、团体旅游和探亲等，从没被问过户籍的问题（现在好像取消了个人旅游签证了） 而且据我所知，即使是北京上海户籍的居民，去日本驻沪或驻京领事馆办理签证时，也不受任何优待，都要提供各种证明文件，与外地人没有任何区别。 所以你不必太担心，只要材料齐全，签证是没有问题的。如果实在不放心的话，可以在户口本上把自己的名字加粗或加黑以方便查询。但我觉得这是多余的，因为你申请的是短期滞在签证，不会有人去详细核查的。
另外再给你一点建议吧：如果你确实想获得长期签证（1年以上），可以委托专门代办机构进行操作。因为一般的中介公司都会掌握比较完整的个人信息资料库，能够比较容易地帮你获得所期望的签证。比如你在一家大型日资企业工作且已干了几年，那基本上没问题；但如果你只是普通打工者或者刚毕业的大学应届生，就比较难了……
补充一句——如果是北京或上海的户口，即使没有居住证也可以拿到商务或留学等长期签证！